La thèse de Thomas Denecker

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Annexes


Annexe 1
Omiques

Une présentation des omiques et des principaux composants (génomique, transcriptomique et protéomique).

Annexe 2
Big Data

Présentation rapide du big data

Annexe 3
Le mot « Data » et ses multiples épithètes

Présentation rapide de la data science, data analysis et data mining

Annexe 4
Comment les graphiques peuvent-ils nous tromper ?

Présentation de 5 cas où les graphiques peuvent nous tromper.

Annexe 5
Quel est la différence entre un package ou librairie avec R ?

Présentation d'un package et d'une librairie en R

Annexe 6
La Gene Ontology

Présentation de 5 cas où les graphiques peuvent nous tromper.

Annexe 7
Puces à ADN double marquage

Présentation des différentes étapes de la technologie de puce à ADN double marquage

Annexe 8
Les biais des puces à ADN et les solutions de normalisation

Présentation des différents biais qui peuvent être rencontrés lors de l'analyse de données de puces à ADN et des solutions

Annexe 9
Acides aminés et protéome

Des acides aminés au protéome.

Annexe 10
Spectrométrie de masse

Présentation de la spectrométrie de masse

Annexe 11
Modifications post-traductionnelles les plus fréquentes

Présentation de la phosphorylation, de la glycolisation, de l’ubiquitination, de la méthylation et de la N-acétylation.

Annexe 12
Homologues, orthologues, paralogues

Définition des homologues, orthologues, paralogues

Annexe 13
Mise en évidence d’un problème d’annotation automatique

Les étapes qui nous ont permis de mettre en évidence un problème d'annotation et comment nous l'avons résolu.

Annexe 14
Les forces et les faiblesses de l’intelligence artificielle

Aperçu des forces et des faiblesses de l’intelligence artificielle