FAIR_bioinfo
Comme vous l’avez lu dans le manuscrit, j’ai monté avec Claire Toffano-Nioche une formation pour apprendre à devenir plus reproductible en bioinformatique. L’objectif est de proposer et d’utiliser un panel d’outils permettant la réalisation d’un projet complet de bioinformatique en partant de rien et aboutissant à la création d’un conteneur (technologie Docker). Le partage, la valorisation et l’analyse dynamique des données seront inclus dans le panel. FAIR correspond à l’acronyme anglais “Findable, Accessible, Interoperable, & Reusable”, initialement défini pour les données mais que nous détournons ici pour leurs protocoles d’analyse. Le projet support est une étude “d’expression différentielle de gènes” à partir de données RNAseq d’O.tauri.
Nous avons mis pour cela deux ressources :